Formation permanente Modélisation Moléculaire 20-22 et 27-29 Septembre 2004

Fichiers structuraux:

    Description du format PDB.
    Introduction concernant le format mmCIF.

• Recherche d'une structure
• rechercher sur le site PDB (http://www.pdb.org) la structure de l'insuline de porc. 
  
•  antisèche

• Contenu des fichiers
• Visualiser le fichier de code 4ins,  rechercher la méthode de résolution et les informations relatives à la qualité des coordonnées
• Ouvrir le fichier 4INS au format CIF, comparer
• Consulter sur le site PDB le fichier 1in2. Quelles informations peut on avoir concernant la qualité de la structure ?
• help
• Sur le site PDB, rechercher l'entrée de code 1AFO. Par quelle méthode expérimentale cette structure a-t-elle été résolue ?
• Rechercher les informations expérimentales ayant guidé sa détermination

• Recherche d'homologues d'un fichiers PDB
• aller a l'URL: http://bioserv.rpbs.jussieu.fr/RPBS/cgi-bin/Ressource.cgi?chzn_lg=an&chzn_rsrc=dbQuery1
• rechercher les homologues de l'Antagonist lgfbp-1 de code 1in2
• lancer une recherche sur le site PDB.org (1in2)
• comparer