Ces services ont été développés par les équipes de RPBS.

• 3DMSS-Sites: Recherche de similitudes structurales (pas d'alignement structural) appliquée à la recherche de sites fonctionnels (catalytiques) dans les structures protéiques.
• Automat: Recherche de séquence.
• Banques de petites molécules: Collections de structures 3D de petites molécules.
• COUDES: Prédiction des coudes (turns) dans les structures.
• CysState: Prédiction de l'état d'oxydation des cystéines d'une protéine.
• FAFDrugs: Collections de structures 3D de petites molécules, filtrage ADME/Tox.
• FunNet: Analyse de réseaux transcriptionnels
• Ambinter: La collection ambinter 2008.
• Frog: Génération de conformation 3D pour des petites collections de petites molécules.
• HCA: Outil d'alignement de séquences à haute divergence.
• iSuperpose: Un outils d'alignement et de superposition structurale des proteines.
• JPBS: Ce service est remplacé par LocPred (Février 2005).
• LocPred: Prédiction de la structure locale des protéines (Protein Blocks).
• PCE: Protein Continuum Electrostatics, calculs du champ electrostatique et du pK apparent.
• PEP-FOLD: Prédiction de novo de la structure de peptides à partir de la séquence en acides aminés.
• PFF: Protein Folding Fragments, fragments du repliement protéique.
• PPG: the Protein Picture Generator, un générateur d'images protéiques.
• PMG: the Protein Movie Generator, un générateur d'animations protéiques de haute qualité graphique.
• PredAcc: Solvent accessibility prediction.
• SABBAC: Reconstruction de structure protéiques à partir des carbones alphas.
• SA-Search: Recherche de similitudes structurales basées sur un alphabet structural.
• SBMap: Une carte sémantique pour la bioinformatique structurale. (recherche de services)
• SCit: Edition des conformations des chaînes latérales.
• SWELFE: Recherche de motifs répétés dans les séquences d'ADN, de protéines, ou les structures protéiques.
• Wloop: Modélisation de la conformation des boucles des protéines.
• wwLigCSRre: Criblage de banques de petits composés pour la recherche 3D de composés similaires.
• Yakusa: Recherche de similitudes structurales basée sur les angles tau (carbones alphas).