Accueil   P-Serveur   Mobyle@RPBS   Services Spécifiques   Logiciels   Tutoriels   Autres serveurs    
Séquences
Structure
Modélisation des structures protéiques
Petites Molécules
 

plan des services du p-serveur

Accéder aux services :

Banques de modèles
Prédiction structurale
Construction automatique de modèles
Evaluation des modèles
 



Banques de modèles


  Banques de modèles

     ModBase
         Base de modèles développée par A. Sali

     SwissModel
         Base de modèles structuraux (modélisation comparative) à partir de UniProt

Prédiction structurale


  Structure secondaire

     PROF
         PROF - Prédiction de structure secondaire, université d'Aberystwyth, Pays de Galles

     COUDES
         Prédiction de beta-turns dans la séquence

  Structure locale

     LocPred
         Prédiction de la conformation locale de la chaine peptidique en termes de blocs protéiques

  Surface Accessible au solvant

     RVP-net
        

  Ponts disulfures

     Cystein bonding and connnectivity
         Prédiction des ponts disulfures (connexité)

Construction automatique de modèles


  Modélisation comparative

     CBSmetaserver
         Metaserveur de modélisation comparative

     Geno3D
         Metaserveur de modelisation comparative

  Modélisation ab initio

     HMMStr
         Serveur HMMStr (Rosetta)

Evaluation des modèles


  Services de validation des structures

     Eval123D
         Suite de validation des structures du CBS (Montpellier)

     PROCHECK
        

     verify3D
         Analyse de la qualité de la structure cristallisée d'une protéine

     Biotech validation suite
        

     Aqua
        
 

Banques de modèles
     liens externes

Structure secondaire
     psi-Pred
     Jnet
     liens externes
Structure locale
     liens externes
Surface Accessible au solvant
     PredAcc
     NetASA
     liens externes
Ponts disulfures
     CysState
     liens externes

Modélisation comparative
     liens externes
Modélisation ab initio
     liens externes

Services de validation des structures
     liens externes